Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms