Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ly6kQ9CWP4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly6kQ9CWP4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6kQ9CWP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6kQ9CWP4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6kQ9CWP4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6kQ9CWP4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6kQ9CWP4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6kQ9CWP4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms