Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snw1Q9CSN1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snw1Q9CSN1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snw1Q9CSN1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms