Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim11Q99PQ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim11Q99PQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms