Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtn4Q99P72 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtn4Q99P72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rtn4Q99P72 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms