Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprtQ99M80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprtQ99M80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprtQ99M80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprtQ99M80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprtQ99M80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
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