Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99M08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q99M08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q99M08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q99M08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q99M08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q99M08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q99M08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q99M08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q99M08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q99M08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q99M08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q99M08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q99M08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q99M08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q99M08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99M08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99M08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99M08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99M08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99M08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99M08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99M08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99M08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms