Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clp1Q99LI9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clp1Q99LI9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clp1Q99LI9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clp1Q99LI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms