Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp5lQ99LH9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp5lQ99LH9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms