Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RtcbQ99LF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RtcbQ99LF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RtcbQ99LF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RtcbQ99LF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RtcbQ99LF4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms