Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dctn2Q99KJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dctn2Q99KJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms