Protein–RNA interactions for Protein: Q924X2

Cpt1b, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1bQ924X2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpt1bQ924X2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpt1bQ924X2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpt1bQ924X2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpt1bQ924X2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpt1bQ924X2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms