Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spdl1Q923A2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdl1Q923A2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms