Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps16Q920Q4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps16Q920Q4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps16Q920Q4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms