Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab4bQ91ZR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab4bQ91ZR1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab4bQ91ZR1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab4bQ91ZR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab4bQ91ZR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 644.3 ms