Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrp1bQ91YK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp1bQ91YK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp1bQ91YK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms