Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdha12Q91Y18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha12Q91Y18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha12Q91Y18 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha12Q91Y18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms