Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y00

Pcdhb2, Protocadherin beta 2, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb2Q91Y00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb2Q91Y00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb2Q91Y00 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb2Q91Y00 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb2Q91Y00 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb2Q91Y00 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms