Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims2Q91XD2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lims2Q91XD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.7 ms