Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pth2Q91W27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pth2Q91W27 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pth2Q91W27 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms