Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cep57l1Q8VDS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep57l1Q8VDS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep57l1Q8VDS7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep57l1Q8VDS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms