Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rprd1aQ8VDS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1aQ8VDS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms