Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mcfd2Q8K5B2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mcfd2Q8K5B2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mcfd2Q8K5B2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mcfd2Q8K5B2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mcfd2Q8K5B2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mcfd2Q8K5B2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms