Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr3Q8K296 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mtmr3Q8K296 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms