Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem17Q8K0U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem17Q8K0U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem17Q8K0U3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem17Q8K0U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms