Protein–RNA interactions for Protein: Q8K083

Znf536, Zinc finger protein 536, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf536Q8K083 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf536Q8K083 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf536Q8K083 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf536Q8K083 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf536Q8K083 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms