Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm28Q8CGC6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm28Q8CGC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm28Q8CGC6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm28Q8CGC6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm28Q8CGC6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbm28Q8CGC6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm28Q8CGC6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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