Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
9030612E09RikQ8CE20 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
9030612E09RikQ8CE20 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms