Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q8CDS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q8CDS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q8CDS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8CDS7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8CDS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CDS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8CDS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q8CDS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms