Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrrc9Q8CDN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrrc9Q8CDN9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lrrc9Q8CDN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrrc9Q8CDN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Lrrc9Q8CDN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms