Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcinQ8CDE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcinQ8CDE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcinQ8CDE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcinQ8CDE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcinQ8CDE2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms