Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ppfibp1Q8C8U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfibp1Q8C8U0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms