Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclre1bQ8C7W7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1bQ8C7W7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms