Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aph1bQ8C7N7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Aph1bQ8C7N7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aph1bQ8C7N7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aph1bQ8C7N7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms