Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc90bQ8C3X2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc90bQ8C3X2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc90bQ8C3X2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms