Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa22Q8C1N8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa22Q8C1N8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms