Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trerf1Q8BXJ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trerf1Q8BXJ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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