Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVT7

4921511C20Rik, RIKEN cDNA 4921511C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921511C20RikQ8BVT7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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4921511C20RikQ8BVT7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921511C20RikQ8BVT7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921511C20RikQ8BVT7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921511C20RikQ8BVT7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921511C20RikQ8BVT7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4921511C20RikQ8BVT7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921511C20RikQ8BVT7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921511C20RikQ8BVT7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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4921511C20RikQ8BVT7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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4921511C20RikQ8BVT7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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4921511C20RikQ8BVT7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921511C20RikQ8BVT7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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4921511C20RikQ8BVT7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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4921511C20RikQ8BVT7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921511C20RikQ8BVT7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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