Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c4Q8BMQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms