Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spock3Q8BKV0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms