Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms