Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AW551984Q8BGF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AW551984Q8BGF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW551984Q8BGF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms