Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc27Q80YS5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc27Q80YS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc27Q80YS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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