Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm5bQ80Y84 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Kdm5bQ80Y84 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5bQ80Y84 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Kdm5bQ80Y84 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm5bQ80Y84 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms