Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc8aQ80WG5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc8aQ80WG5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc8aQ80WG5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8aQ80WG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc8aQ80WG5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc8aQ80WG5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms