Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdccag8Q80UF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag8Q80UF4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdccag8Q80UF4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdccag8Q80UF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms