Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RubcnQ80U62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RubcnQ80U62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RubcnQ80U62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnQ80U62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RubcnQ80U62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms