Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms