Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl35Q6ZWV7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl35Q6ZWV7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms