Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp34Q6ZQ93 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp34Q6ZQ93 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp34Q6ZQ93 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms